どの教会もキリストの教会である…。（一部除く）
日本におけるキリスト者（クリスチャン）の割合は、0.8％とか0.3％だとか言われている。その割にはあちこちに教会がある。特に都市部において。
| 日本イエス・キリスト教団待望教会 | 会津若松市大町2-5-34 |
| 日本キリスト教団会津若松教会 | 会津若松市宮町9-20 |
| 日本キリスト教団只見伝道所跡 | 南会津郡只見町只見字田中1085 |
| 桐生キリスト聖書教会 | 桐生市本町6-380 |
| 救世軍桐生小隊 | 桐生市仲町2-14-15 |
| 日本聖公会草津聖バルナバ教会 | 吾妻郡草津町草津289 |
| 日本聖公会聖慰主教会 | 吾妻郡草津町乙289 |
| 日本聖公会川越キリスト教会 | 川越市松江町2-4-13 |
| ケンクレア教会 | 川口市芝新町7-10 |
| イムマヌエル綜合伝道団船橋キリスト教会 | 船橋市本町1-31-4 |
| 日本キリスト教団松戸教会 | 松戸市松戸1394 |
| 日本キリスト教団銀座教会 | 銀座4-2-1 |
| 救世軍月島小隊 | 月島2-17-10 |
| 日本キリスト教団九段教会 | 外神田3-5-11 |
| 日本キリスト教団番町教会 | 九段北1-15-1 |
| 大韓イエス教長老会所望教会 | 赤坂3-21-8 |
| 御茶の水キリストの教会 | 四番町7-5 |
| 救世軍神田小隊・救世軍本営 | 神田神保町2-17 |
| カトリック神田教会 | 西神田1-1-12 |
| 日本キリスト教団富士見町教会 | 富士見2-10-38 |
| 日本キリスト教団赤坂教会 | 赤坂6-9-6 |
| 明治学院礼拝堂 | 白金台1-2-37 |
| キリスト友会東京月会 | 三田4-8-19 |
| 大韓イエス教長老会所望教会 | 赤坂3-21-8 |
| 日本キリスト教団麻布南部坂教会 | 南麻布4-5-6 |
| 日本ルーテル教団六本木ルーテル教会 | 六本木6-16-44 |
| カトリック関口教会 | 関口3-16-15 |
| 日本バプテスト連盟茗荷谷キリスト教会 | 大塚1-1-18 |
| 日本キリスト教団根津教会 | 根津1-19-6 |
| ロシア正教会モスクワ総主教庁駐日ポドウォリエ | 本駒込2-12-17 |
| 日本キリスト教団本郷中央教会 | 本郷3-37-9 |
| 日本福音ルーテル本郷教会 | 本郷6-5-13 |
| 基督心宗教団東京教会 | 千石3-19-2 |
| 同仁キリスト教会 | 目白台3-10-9 |
| 日本福音宣教会東京ホープチャペル | 寿2-1-6 |
| 日本キリスト教団下谷教会 | 東上野3-37-10 |
| 上野の森キリスト教会 | 東上野5-11-9 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団浅草シティチャーチ | 浅草7-5-1 |
| 大韓イエス教長老会本郷宣教教会 | 錦糸2丁目9 |
| 純福音東京教会錦糸町支聖殿 | 江東橋4-10-5 |
| エデン教会 | 石原 1-12-15 |
| 日本バプテスト連盟大井バプテスト教会 | 大井5-10-12 |
| Kreuzkirche Tokyo（ドイツ語福音教会） | 北品川6-5-26 |
| イムマヌエル綜合伝道団中目黒教会 | 上目黒1-12-7 |
| 日本ナザレン教団目黒教会 | 青葉台4-7-6 |
| 日本バプテスト連盟恵泉バプテスト教会 | 中目黒3-13-29 |
| ロシア正教会モスクワ総主教庁駐日ポドウォリエネワ聖大候アレクサンドルの聖堂 | 下目黒6-2-2 |
| 日本キリスト教団蒲田教会 | 蒲田1-22-14 |
| 日本聖公会大森聖アグネス教会 | 南馬込1-58-8 |
| 日本キリスト教団馬込教会 | 南馬込4-3-5 |
| 大森福興教会 | 山王2-12-10 |
| 日本キリスト教団経堂緑岡教会 | 経堂1-30-21 |
| 東京ホライズンチャペル世田谷チャペル | 桜丘5-21-7 |
| 日本キリスト教団千歳船橋教会 | 桜丘5-26-16 |
| 日本ナザレン教団三軒茶屋教会 |
三軒茶屋2-19-15 |
| 日本自由キリスト教会 | 北沢5-14-10 |
| 日本キリスト教団松沢教会 | 上北沢3-8-14 |
| 日本キリスト改革派東京恩寵教会 | 恵比寿西1-33-9 |
| 日本バプテスト連盟渋谷バプテスト教会 | 桜丘町14-5 |
| 日本キリスト教団中渋谷教会 | 桜丘町8-22 |
| 日本キリスト教団美竹教会 | 渋谷1-17-17 |
| 日本キリスト教団渋谷教会 | 渋谷2-14-12 |
| 日本キリスト教団東京山手教会 | 宇田川町19-5 |
| セブンスデー・アドベンチスト教団東京中央教会 | 神宮前1-11-1 |
| 日本キリスト教団ベテル教会 | 富ヶ谷1-35-9 |
| 国際基督教団代々木教会 | 代々木1-29-5 |
| 日本基督会渋谷会 | 松濤1-25-6 |
| 道会 | 神山町21-11 |
| 日本キリスト教団千歳教会 | 鷺宮3-39-4 |
| 日本キリスト教団聖書之友教会 | 上高田4-39-10 |
| シオンの群教会 | 上高田4-46-9 |
| 日本キリスト教団白鷺教会 | 白鷺2-47-10 |
| 中野キリスト教会 | 新井1-37-7 |
| 日本ホーリネス教団新井キリスト教会 | 新井3-3-1 |
| 日本バプテスト連盟中野バプテスト教会 | 中野2-23-8 |
| 中央キリストの福音教会 | 中野2-29-1 |
| 日本キリスト教団中野桃園教会 | 中野5-3-14 |
| キリスト同信会東京中野パークサイドチャーチ | 中野1-45-12 |
| 日本長老教会東京ホサナ教会 | 東中野1-57-7 |
| 日本同盟基督教団中野教会 | 東中野2-21-7 |
| 日本キリスト教団東中野教会 | 東中野3-8-6 |
| キリスト教待晨集会 | 白鷺2-22-2 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団新中野キリスト教会 | 本町6-37-7 |
| 日本キリスト教団野方町教会 | 野方6-26-9 |
| 聖書キリスト教会東京シャローム教会 | 野方1-1-12 |
| 日本聖公会阿佐ヶ谷聖ペテロ教会 | 阿佐谷北2-16-11 |
| 日本キリスト教団阿佐ヶ谷教会 | 阿佐谷北5-18-10 |
| 久遠キリスト教会 | 阿佐谷北2-25-8 |
| 日本キリスト教団井草教会 | 井草1-42-6 |
| 日本キリスト教団高円寺教会 | 高円寺北2-35-7 |
| 馬橋キリスト教会 | 高円寺北4-24-11 |
| 日本長老教会井荻福音キリスト教会 | 上井草1-28-13 |
| 日本キリスト教団荻窪清水教会 | 清水1-25-17 |
| 日本福音教団聖徒教会 | 善福寺1-16-16 |
| 日本キリスト教団荻窪教会 | 荻窪4-2-10 |
| イエス之御霊教会教団東京イエス之御霊教会 | 荻窪5-19-2 |
| 日本キリスト教団西荻教会 | 西荻北2-11-3 |
| 日本キリスト教団西荻北教会 | 西荻北4-17-7 |
| 福音伝道教団福音キリスト教会西荻チャペル | 西荻北4-12-12 |
| 日本福音キリスト教会連合西荻南イエス・キリストの教会 | 西荻南4-11-9 |
| 日本ハリストス正教会教団山手ハリストス正教会 | 宮前3-28-10 |
| 日本キリスト教会荻窪北教会 | 天沼2-5-23 |
| セブンスデー・アドベンチスト教団天沼教会 | 天沼3-17-3 |
| 日本バプテスト同盟杉並中通教会 | 桃井1-9-6 |
| 日本キリスト教団杉並教会 | 和田3-48-8 |
| 日本キリスト教団高井戸教会 | 高井戸西1-27-18 |
| 日本バプテスト同盟東京平和教会 | 駒込1-28-8 |
| 日本キリスト教団駒込教会 | 駒込2-3-8 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団中央聖書教会 | 駒込3-15-20 |
| 中央聖書神学校 | 駒込3-15-20 |
| 日本キリスト教団巣鴨教会 | 南大塚1-13-8 |
| 日本キリスト教会主僕教会 | 雑司が谷3-4-5 |
| 喜ぶ教会 | 高田3-3-22 |
| 日本キリスト教団池袋西教会 | 池袋4-2-10 |
| 日本キリスト教団東京池袋教会 | 西池袋3-5-18 |
| シャロン・ゴスペル・チャーチ | 西池袋5-2-1 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団中央福音教会 | 東池袋3-15-9 |
| 基督兄弟団東京新生教会 | 千早2-1-3 |
| カトリック豊島教会 | 長崎1-28-22 |
| 日本同盟基督教団椎名町教会 | 南長崎4-2-6 |
| 日本キリスト教団東長崎ウエスレー教会 | 南長崎5-6-1 |
| 日本キリスト教目白町教会 | 目白2-20-3 |
| 日本キリスト教団武蔵野教会 | 目白5-16-3 |
| 日本キリスト教団要町教会 | 要町1-43-15 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団十条キリスト教会 | 上十条2-20-9 |
| 日本キリスト教団滝野川教会 | 上中里1-1-12 |
| 日本キリスト教団赤羽教会 | 志茂2-56-4 |
| カトリック赤羽教会 | 赤羽2-1-12 |
| 東京芸能教会 | 東日暮里6-24-19 |
| 日本聖公会神愛教会 | 東日暮里5-18-8 |
| イエス教日本世界宣教会平和キリスト教会 | 東日暮里5-28-5 |
| 東京福音教会 | 東日暮里2-45-9 |
| セブンスデー・アドベンチスト教団東京韓国人教会 | 東日暮里6-19-7 |
| 日本バプテスト連盟シャローム教会 | 西日暮里6-27-1 |
| 東京ハーベスト教会 | 荒川1-58-6 |
| 日本聖泉基督教会連合荒川聖泉キリスト教会 | 荒川3-17-3 |
| 日本バプテスト連盟常盤台バプテスト教会 | 常盤台2−3−3 |
| 日本同盟基督教団石神井福音教会 | 下石神井4-21-16 |
| 日本キリスト教団下石神井教会 | 下石神井5-4-17 |
| 日本バプテスト教会連合石神井バプテスト教会 | 下石神井6-19-8 |
| 日本キリスト教団石神井教会 | 石神井町6-32-9 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団練馬キリスト教会 | 関町南2-24-4 |
| セブンスデー・アドベンチスト教団三育関町キリスト教会 | 関町南2-8-4 |
| カトリック関町教会 | 関町北2-11-7 |
| 大泉セントラルチャペル | 東大泉3-20-11 |
| 日本バプテスト連盟大泉バプテスト教会 | 東大泉6-42-30 |
| 聖書キリスト教会 | 豊玉北1-12-3 |
| キリスト聖教団練馬教会 練馬グレースチャペル | 栄町10-2 |
| 日本キリスト教団亀有教会 | 亀有2-27-3 |
| 日本ホーリネス教団本田キリスト教会 | 東立石4-48-5 |
| 大韓イエス教長老会東京インマヌエル教会 | 新小岩1丁目42 |
| 日本聖公会聖パトリック教会 | 羽衣町3-15-24 |
| 日本福音自由教会協議会東京武蔵野教会 | 吉祥寺北町1-2-12 |
| 日本キリスト教団武蔵野扶桑教会 | 吉祥寺北町3-7-11 |
| 純福音エルサレム教会 | 吉祥寺北町3丁目4-4 |
| 使徒的実現チャーチ東京 | 吉祥寺本町2丁目27-2 |
| 日本キリスト教団東美教会 | 吉祥寺本町4-14-9 |
| 吉祥寺キリスト集会 | 吉祥寺本町4-9-11 |
| カトリック吉祥寺教会 | 御殿山1-7-8 |
| 三鷹栄光キリスト教会 | 西久保3丁目81 |
| 日本バプテスト連盟三鷹バプテスト教会 | 下連雀4-18-3 |
| 東京フリー・メソジスト小金井教会 | 本町5-8-7 |
| 日本バプテスト連盟花小金井キリスト教会 | 花小金井1-26 |
| カトリック愛徳会 | 青葉町多磨全生園 |
| 多磨全生園秋津教会 | 青葉町多磨全生園 |
| 日本聖公会聖フランシス・聖エリザベツ礼拝堂 | 青葉町多磨全生園 |
| 日本バプテスト教会連合国分寺バプテスト教会 | 内藤1-10-77 |
| カンバーランド長老キリスト教会国立のぞみ教会 | 東3-15-9 |
| 横田インターナショナル・クリスチャン・アッセンブリー | 熊川1437 |
| 横田キリストの教会 | 熊川武蔵野1148-3 |
| 日本聖公会小笠原聖ジョージ教会 | 小笠原村父島西町35 |
| 日本バプテスト連盟百合丘キリスト教会 | 川崎市麻生区百合丘1-12 |
| 日本福音キリスト教会連合主都福音キリスト教会 | 川崎市麻生区百合丘1-18-8 |
| 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団麻生キリスト教会 | 川崎市麻生区百合丘2-9-1 |
| 日本キリスト教団紅葉坂教会 | 横浜市西区宮崎町1 |
| 日本キリスト教会横浜海岸教会 | 横浜市中区日本大通8 |
| 福音喫茶メリー | 横浜市中区野毛町1-12 |
| 救世軍横浜小隊横須賀分隊 | 横須賀市安浦町1-10 |
| 日本キリスト教団大磯教会 | 中郡大磯町大磯1348 |
| カトリック諏訪教会 | 諏訪市湖岸通り4-1-36 |
| アビバメント ダ フェ福音教会 | 諏訪市諏訪1丁目14-10 |
| 日本聖公会中部教区新生礼拝堂 | 上高井郡小布施町851 |
| 日本キリスト教団伊東教会 | 伊東市松川町5-6 |
| 日本キリスト教団名古屋教会 | 名古屋市中区丸の内3-4-5 |
| 日本キリスト教団名古屋中村教会 | 中村区中村町6-43-2 |
| 日本イエス・キリスト教団京都聖徒教会 | 京都市北区小山上総町50-1 |
| 日本福音自由教会協議会京都福音自由教会 | 京都市北区小山東大野町33-2 |
| カトリック西院教会 | 京都市中京区壬生仙念町23 |
| 日本ペンテコステ教団大阪エリムキリスト教会 | 大阪市浪速区恵美須西3丁目2-4 |
| 日本キリスト教広島流川教会 | 広島市中区上幟町8-33 |
| 日本キリスト教団卯之町教会 | 西予市宇和町卯之町3-104－2 |
| カトリック鹿児島カテドラル・ザビエル教会 | 鹿児島市照国町13-42 |
| 日本キリスト教団真和志教会 | 那覇市泊2-10-8 |
| 日本バプテスト連盟那覇新都心キリスト教会 | 那覇市銘苅3-21-46 |
| 沖縄バプテスト連盟首里バプテスト教会 | 那覇市首里山川町1-17 |
| 日本キリスト教団志真志伝道所 | 宜野湾市志真志4-24-7 |
| 沖縄バプテスト連盟普天間バプテスト教会 | 宜野湾市野嵩2-23-1 |
| カトリック愛楽園巡回教会 | 名護市字済井出1192 |
| 日本聖公会愛楽園祈りの家教会 | 名護市済井出1192 |
| 日本キリスト教団佐敷教会 | 南城市佐敷仲伊保470-2 |
| 日本キリスト教団読谷教会 | 中頭郡読谷村字上地38 |